"키마이라 트러블"은 1995년 대한민국에서 살고 있는 "서■■"이 "아클락스"에서 만들어진 전투 실험체 3인을 만나는 것으로 스토리가 전개되는 비주얼 노벨입니다. 이야기가 진행됨으로서, 그 과정에서 밝혀지는 진실과 주인공이 마주하는 또 다른 진실. 주인공과 실험체 세 명은 생존을 위해 발악하게 될 것입니다.